在发生工伤时他们并没有第一时间派人过来看，过了3天后，出院两个月后叫我填写借款单

公司让填借款单不合理，工伤医疗费本就该公司承担。你可和公司说明这一万元是支付工伤医疗费，并非借款，拒绝填写借款单。若公司坚持，你要保留好医院费用单据、打款记录等证据。若之后公司不承担其余医疗费，可通过法律途径维权，要求公司支付全部合理的工伤医疗费用。
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针对您提到的公司要求填写借款单的问题，这实际上可能涉及到您与公司之间的财务往来性质。根据《工伤保险条例》的相关规定，工伤医疗费用应由工伤保险基金支付，而非由员工个人承担。因此，公司要求您填写借款单可能并不符合工伤处理的正规流程。如果这一万元被明确标识为工伤医疗费用预付款，且后续工伤保险基金支付了相应费用，那么理论上您不需要偿还这一万元。但具体情况还需根据您与公司之间的协议以及实际支付情况来判断。
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从法律角度，您垫付的医药费应通过以下途径追回：首先，确保您已经完成了工伤认定程序，这是获取工伤保险赔偿的前提。其次，根据《工伤保险条例》的规定，向工伤保险基金申请支付医疗费用。如果工伤保险基金已经支付了相关费用，但公司未将款项转交给您，您可以要求公司返还。若公司拒绝返还，您可以考虑通过法律途径解决，如提起劳动仲裁或诉讼。
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若您认为公司处理工伤的方式不合法，可以采取以下措施：首先，收集所有与工伤相关的证据，包括医疗费用单据、工伤认定证明等。其次，与公司的人力资源部门或管理层进行沟通，明确表达您的诉求和法律依据，如《工伤保险条例》的相关规定。若沟通无果，您可以向当地的劳动监察部门投诉，或寻求劳动仲裁委员会的帮助，必要时还可以提起劳动诉讼。
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